蘇花改蘇澳至東澳段於民國107年2月5日開放小型車通行後，交通部公路總局隨即展開因應開放大客車通行之多方測試驗證，在與宜蘭縣政府警、消、衛生等聯防單位的共同努力下，透過實際車流狀況應變、設施功能測試與防災整備等，已完成因應的應變與管理準備，經提送大客車通行評估報告函報交通部核定後，訂於107年5月7日上午7時30分時開放大客車通行。 
公路總局表示，蘇花改蘇澳至東澳段開放大客車後，通行車種限於小型車及大客車，在蘇澳地區已規劃相關疏導動線並設置指示標誌，國道5號往蘇花改方向之小型車與大客車請行駛「國道5號→新馬陸橋→台9線→箕山橋→蘇港路→蘇花改」；回程則行駛「蘇花改→蘇港路→箕山橋→台2戊→海山西路→國5」。 
另為配合此路段開放通行大客車，公路總局與宜蘭縣政府已同步規劃2條市區客運路線由蘇澳行駛至南澳及東澳，提供地區公共運輸服務；為鼓勵民眾響應搭乘公共運輸，並將於5月7日當日起提供7天『免費』搭乘之優惠。2條路線服務資訊如下： 
1. 國光客運【122】蘇澳轉運站-南澳車站 
 班次：往、返各5班次 
 行駛里程：約22.8公里 
 行駛動線：蘇澳轉運站-太平路-中山路-中興巷-蘇港路-東澳隧道-東澳-南澳車站 
 停靠站位：蘇澳轉運站、東澳車站、南澳鄉公所、南澳火車站(因蘇澳轉運站尚未建置完成，蘇澳發車點暫為：國光蘇澳站，地點：宜蘭縣蘇澳鎮蘇北里10鄰中山路一段96號) 
 票價：2段票，每段20元(以東澳為分段點) 
2. 大都會客運【121】蘇澳車站-東澳車站 
 班次：往、返各3班次 
 行駛里程：約13公里 
 行駛動線：蘇澳車站-蘇南路-中興巷-蘇港路-東岳隧道-蘇花路三段-東澳車站-東岳湧泉 
 停靠站位：蘇澳車站、東澳車站、東岳湧泉 
 票價：1段票，每段20元 
此外，為維護此路段開放大客車通行後之安全，公路總局宜蘭監理站將會同警察機關常態性每月將排定6至7班次在蘇澳與東澳地磅站執行大客車聯稽路檢勤務，通車初期並將加強辦理，藉由聯合稽查勤務對大客車駕駛人及車輛安全門、緊急逃生口、擊破器及輪胎等設備加強安全查核，確保大客車行車安全。另為強化蘇花改路段大客車行車安全觀念，公路總局已製拍宣導影片並上傳youtube供下載瞭解，且已轉送遊覽車客運業者於車上播放宣導。 
公路總局提醒各用路人與大客車駕駛人特別注意，蘇花改行車速限為60公里，大客車與前車請保持100公尺安全距離，小客車與前車請保持50公尺安全距離，並行駛左側車道，禁行右側之緊急救援車道，更禁止超速、超車等危險駕駛行為；行車前請先至公路總局第四區養護工程處網站參閱「台9線蘇花公路蘇澳-東澳段通車宣導」，瞭解相關行車安全須知及各種行車管制規定，並多利用公路總局省道即時路況系統（http://168.thb.gov.tw）並隨時注意收聽廣播訊息。